Der "Emmenschachen" ist das Gebiet zwischen Emme und Emmekanal im Mündungsbereich der Emme in die Aare. Das Naturreservat befindet sich auf der Ostseite der letzten 600 Meter des Emmeneinlaufs in die Aare.
Es ist Teil des Auengebietes von nationaler Bedeutung (SO 45). Das Gebiet steht bei Hochwasser regelmässig unter Wasser und ist aus diesem Grund sehr wertvoll. In den Tümpeln des Emmenschachens fühlen sich besonders Amphibien wohl. Das Gebiet ist auch ein wichtiger Überwinterungsort für Zugvögel und ist deshalb vor allem für Vögel von grosser Bedeutung.
Unmittelbar nördlich an das Auengebiet „Emmenschachen“ grenzt das Wasser- und Zugvogelreservat von internationaler und nationaler Bedeutung Nr. 113 „Aare bei Solothurn und Naturschutzreservat Aare Flumenthal“ an. Eisvogel-Vorkommen sind entlang des untersten Emmeabschnitts vor allem am rechten Ufer bekannt. Zudem ist hier der Pirol heimisch. Auch der Kleinspecht und Fitis als typische Auenarten kommen im Gebiet vor.